|
Vol 44(2010) N 5 p. 823-831; Y.V. Dutikova1, O.F. Borisova2, A.K. Shchyolkina2, J. Lin3, S. Huang4, A.A. Shtil1, D.N. Kaluzhny2* 5,10,15,20-Tetra-(N-methyl-3-pyridyl)porphyrin Destabilizes the Antiparallel Telomeric Quadruplex d(TTAGGG)4 1Blokhin Cancer Research Center, Russian Academy of Medical Sciences, Moscow, 115478 Russia2Engelhardt Institute of Molecular Biology, Russian Academy of Sciences, Moscow, 119991 Russia 3National Yang-Ming University, Taipei, Taiwan (Republic of China) 4National Defense Medical Center, Taipei, Taiwan (Republic of China) *uzhny@mail.ru Received - 2010-02-11; Accepted - 2010-04-13 5,10,15,20-тетра-(N-метил-3-пиридил)порфирин (TMePyP3) - представитель ДНК-связывающих производных порфиринов. Проведено сравнительное исследование характера связывания этого лиганда с биологически значимыми структурами ДНК. С этой целью изучено взаимодействие TMePyP3 с антипараллельным теломерным G-квадруплексом d(TTAGGG) 4, олигонуклеотидом dTTAGGGTTAGAG(TTAGGG) 2, не образующим квадруплексную структуру, двухцепочечными d(AC) 8d(GT) 8 и одноцепочечными d(AC) 8 и d(GT)8 молекулами ДНК. Анализ изотерм адсорбции показал, что константы и число мест связывания комплексов TMePyP3 : ДНК увеличивались в ряду d(AC) 8 < d(GT) 8 < d(AC) 8d(GT) 8 = d(TTAGGG) 4 < dTTAGGGTTAGAG(TTAGGG) 2. Впервые установлено, что константа связывания TMPyP3 с развернутой нитью dTTAGGGTTAGAG(TTAGGG) 2 (1.3×107 M-1) примерно в 3 раза больше, чем с G-квадруплексом d(TTAGGG)4 (4.7×106 M-1). Адсорбция двух молекул TMPyP3 на d(TTAGGG) 4 понижала термостабильность G-квадруплекса (ΔТпл = -8°С). Спектры кругового дихроизма комплексов TMPyP3 с d(TTAGGG) 4 свидетельствовали о частичном разворачивании лигандом G-квадруплексной структуры. Дестабилизация структуры теломерного квадруплекса в комплексе с TMPyP3 может объяснить относительно низкую активность этого лиганда как ингибитора теломеразы и индуктора гибели опухолевых клеток. 5,10,15,20-tetra(N-methyl-3-pyridyl) porphyrin (TMPyP3), G-quadruplex, adsorption isotherms, fluorescence, circular dichroism, energy transfer, UV melting |
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
